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Le rôle principal du Comité consiste à donner des lignes directrices et des avis sur la doctrine et la stratégie militaires. Il est chargé de recommander aux autorités politiques de l'Organisation les mesures qu'il juge nécessaires à la défense commune de la zone de l'OTAN et de mettre en œuvre les décisions qui concernent les opérations et missions de l’OTAN.
L’avis du Comité militaire est naturellement sollicité avant que le Conseil de l'Atlantique Nord , la plus haute instance décisionnelle de l'OTAN, ou le Comité des plans de défense n’autorise des activités ou opérations militaires de l’OTAN.
Il représente donc un lien essentiel entre le processus politique de prise de décision et la structure militaire de l’OTAN et fait partie intégrante du processus décisionnel de l’Alliance.
Le Comité politique joue également un rôle clé dans l’élaboration de la politique et de la doctrine militaire de l’OTAN dans le cadre de débats au sein du Conseil, du Comité des plans de défense et du Groupe des plans nucléaires et d’autres organismes de haut niveau. Il est chargé de fournir des orientations militaires aux deux Commandements stratégiques de l'OTAN, le Commandement allié Opérations et le Commandement allié Transformation.
Dans ce contexte, le Comité contribue à l'élaboration des concepts stratégiques globaux de l'Alliance et il établit une évaluation annuelle à long terme du potentiel et des capacités des pays et des zones présentant un risque pour les intérêts de l'OTAN.
En période de crise ou de tension, ou en temps de guerre, et dans le cadre des opérations militaires entreprises par l’Alliance, notamment en Bosnie-Herzégovine, au Kosovo et en Afghanistan, il a pour autres responsabilités de donner au Conseil et au Comité des plans de défense des avis sur la situation militaire et de formuler des recommandations concernant le recours à la force armée, la mise en oeuvre de plans de circonstance et l'élaboration de règles d'engagement appropriées.
Il est également responsable du bon fonctionnement de ses organismes subordonnés.
